5月20日上午中东呼吸综合征（MERS）第1例患者出现在平泽圣母医院，疾病管理本部（以下简称‘疾本’）向该患者待过的四家医院派遣了4个流行病调查小分队。他们接受了为期2周的防疫调查教育，是投入防疫的公众保健医生新手。

在现场工作的一名调查官表示，“我们没有调查流行病的经验，只是按照书上说的进行了调查”。医院相关负责人称，“即使患者有可能在医院内部走动，但也没有想过要把所有楼内的监控录像都翻看一遍”。随着防疫调查产生漏洞，防疫的第一步就没有迈好。只隔离并调查了和第1例患者密切接触的10多名该医院的医疗人员。 　

和第1例患者不住同一病房的第6例患者（71岁，已故）5月28日被确诊，而事态也已经演变得相当糟糕。这一时期超级传播者（第14例患者）从其他医院送至三星首尔医院急救室。

MERS登陆国内并传播开的过程中，保健当局和医院对陌生病毒真的是一无所知。为阻止MERS扩散，防疫专家本应挺身而出，但疾本内部却没有防疫专家。结果疾本因过度依赖感染内科专家大韩感染学会金宇柱理事长而受到外部指责。金理事长在MERS扩散初期曾说，“与患者在1~2米的距离内握手、说话一个小时以上就属于密切接触”。疾本以此为标准缩小了防疫网，以致无法阻止除了第1例患者住过的病房即在其他病房和楼层出现病例患者。 　

疾本组织最大的问题是，在930名员工中有624名是临时员工（非正式员工）。疾本的一位非正式研究员表示，“因为看不到转为正式员工的机会，一般都是在这里积累经验，然后瞅准机会成为其他研究所的正式员工或大学教授”。随时会走人的这种状态，也根本无暇积累多少经验。在SARS、甲流时期工作过的医疗人员现在基本都不在疾本。

疾本内部的医生只有22名（2.36%）。大学预防医学会MERS委员长奇牡丹指出，“保健福祉部文亨杓部长是不是也说过‘在非常不常见的工作上无法投入正式员工’？能够通过正式员工选拔医生的岗位本身就没几个”。对此，前疾本本部长全柄律指出，“福祉部只是给疾本派遣一些说不定哪天就走人的官僚，因此才没能做好初期应对”。 　

基本组织本身没有职权也是问题。疾本本部长属于室长级别（第一级别），受福祉部管理并且没有预算权和人事权。本部长平均任期为2年，缺乏专业性和连续性。在非常时期，本部长没有实施封闭医院、公开医院名单、进行强制隔离等措施的法律依据。因此很难获得医院、地方政府负责人、其他部门领导的合作。对于抑制传染病来说，虽然公开医院信息是最有效果的，面对医院和政府的反对，疾本本部长也无法贯彻实施自己的主张。奇牡丹委员长指出，“因为没有职权，很难承担实施封闭医院或隔离患者的责任，应对也被拖延”。美国疾病控制与预防中心（CDC）主任的平均任期为4.3年，最长可达11年，并且还有预算权和人事权。美国国防部首席流行病调查官卓尚宇（音）表示，“美国CDC的主任被认为是防疫领域最权威的专家，并且在非常时期主导防疫战略”。 　

为了阻止第二个MERS事态的发生，加强疾本的力量迫在眉睫。应该选拨专家并给予积累经验的机会。首尔大学医学院姜大熙教授表示，“在美国，医学博士出身的研究员在政府机关工作时，会支付比一般研究员多三倍的年薪。只有选拔人才并提供好的待遇，才能选拔出更好的人力资源”。首尔大学医学院李钟求教授建议，“把疾本提升为疾病管理厅，设置中央指挥所和流行病调查中心，以应对危机”。