金正男被杀事件疑似朝鲜所为，朝中关系或因此事更为恶化。专家分析称，继2013年12月张成泽被肃清事件后，本次事件可能使朝中关系再次陷入冰点。

2月15日，出席韩国国会情报委员会会议的韩情报院院长李炳浩对于“中国是否曾保护金正男”的问题回答“是的”。据韩国情报委员会委员称，李炳浩曾表示“朝鲜明知这样做会令朝中关系恶化却依然故我，由此可以看出金正恩的行动相当难以预测”。熟悉朝中关系的中方专家称，“截至2012年年底，金正男一直拥有一套位于北京郊外的私人住所，但他则住在中国军方安排的住所，接受中方的保护”，“在曾是其庇护人的张成泽被肃清后，金正男再也没有在北京出现过”。中国在2012年金正恩政府上台前就将金正恩同父异母的哥哥金正男和金正恩的姑父视为亲华人士进行保护，在金正恩上台后也依旧如此。

韩国统一部相关负责人表示，“中国对金正男的保护并非是想推翻金正恩政权，换言之中国并没有‘政权更迭（regime change）’的想法”，“在没有人能确定金正恩政府是否能站稳脚跟的情况下，这只是中国为应对众多可能性制定的B计划（Plan B）而已”。另一位熟悉朝中关系的中方专家也表示，“中国也一直在想办法应对金正恩政府崩溃的情况”，“出现紧急情况时，为了朝鲜的稳定，需要有一个过渡期，此时金正男就是能帮助朝鲜度过过渡期的人，但是现在金正男被杀，这一计划也变得毫无意义了”。但是朝鲜认为这是在干涉他们的内政，并认为中国不断对其施压，因此朝鲜一直都在直接或间接地表明对中方不满的情绪。

如果中国把2月12日朝鲜在特朗普政权上台后首次发射导弹一事也看作问题的话，朝中间的矛盾可能进一步加深。韩国政府相关负责人表示，“朝鲜在试射导弹前并未向中国进行通报”。中国原本就在密切关注特朗普政府的对华施压政策，朝鲜此举可谓是更加刺激了中国。

2月13日，中国外交部发言人耿爽在例行记者会上回答有关朝鲜发射中程弹道导弹（IRBM）“北极星2”的问题时表明了中方的立场，“中方反对朝方违背安理会决议进行发射活动”。韩国外交部相关负责人表示，“这是中国首次‘反对朝鲜发射导弹’”，“虽然一直以来中国对朝鲜发射导弹的事件表现出遗憾甚至担忧的态度，但与过去的发言相比，此次发言更加强硬”。中国在进行导弹试射的第二天（2月13日），以水银含量超标为由，退回了朝鲜生产的1.6296万吨煤炭（价值约合100万美元）。

中国外交部在2月13日的例行记者会上仅表示“此事发生在马来西亚”，并回避了与此相关的话题。对于“金正男的家属现在是否生活在澳门”的问题，中方表示“并不知情”。曾担任韩国驻中国香港总领事的韩国圆光大学韩中政治外交研究所所长石东演表示，“金正恩上台后从未访问过中国，可见自2012年之后朝中关系呈逐步恶化的趋势”，“如果金正男遭暗杀一事确认是朝鲜所为，这将会成为继张成泽被肃清后朝中关系改善的又一不利因素”。在2013年12月张成泽被肃清6个月后的2014年5月，朝鲜劳动党副委员长（时任朝鲜人民军总政治局局长）崔龙海曾带领使团来华访问，谋求两国关系正常化。当时崔龙海手持金正恩的亲笔书信，但却在住处等了整整一天希望获得与中国国家主席习近平会面的机会，不得不甘愿承受中方的冷落。