国内企业重新掌握了由于外汇危机导致流落到外国公司手中的兴农种苗、中央种苗和它们拥有的各种农产品种子事业权。

9月13日，东部集团的农业领域子公司东部韩农表示从美国种子企业孟山都(Monsanto)处获得了孟山都Korea种子事业权，并签订了合同。内容是对萝卜、白菜、黄瓜、洋葱等8个种250个种子事业权的移交，达到了孟山都韩国拥有的310个种子(12个种)的80%。萝卜、白菜、黄瓜方面孟山都占据了国内市场的25%左右。东部和孟山都根据合约要求，并未公布收购金额。

东部韩农代表禹钟一表示“比起其他，最重要的意义是恢复了部分种子主权”。1997年末外汇危机后，随着本土种苗公司企业转向外国企业，甚至大多数本土农产品种子都为外国公司持有，但此次合同差不多可以说是收回了种子主权。

外汇危机前的本土种子市场曾经是国内企业的天下。兴农种苗、首尔种苗、中央种苗分别占据了1~3位的排名，但是它们都未能安然度过金融危机。公司债利率以年均30%以上的速度飙升，使它们陷入了资金困难。

忙于自救而晕头转向的国内大企业纷纷无暇顾及这些种子公司，最终还是转移到了外国企业手中。兴农种苗和中央种苗被墨西哥圣尼秘斯、首尔种苗被瑞士Syngenta、在业界排名第7位的清源（音）种苗被日本坂田收购。萝卜、白菜、辣椒等本土蔬菜种子的50%由外国企业所拥有。同时，国内蔬菜种子市场的70%左右也由外国企业所占据。之后孟山都收购了圣尼秘斯等，根据和外国企业之间的收购和合并(M&A)，更换了本土种子的主人。

外国企业将其确保的农产品种子供应给国内种植户并收取特许权使用费。据业界推算，大体上总公司拿走了种子销售价的5~10%作为特许权使用费。一边培育本土农产品给国内消费者食用，一边还得向外国公司缴纳特许权使用费。食用青阳辣椒也向孟山都缴纳了特许权使用费。这是因为进入80年代，虽然中央种苗改良本土种子批量生产了青阳辣椒，但该公司终究是属孟山都所有的。在这种情况下，种子业界甚至传出了“种子主权和餐桌的自尊心轰然倒塌”的说法。这意味着将从外国企业那里买种子栽培本土农作物来食用。

农村振兴厅研究官郑应基(音)表示“虽然尚未公开，但跨国企业也有可能对韩国本土作物进行改良后出口到第三国。”结果是和种子企业一起，连种子主权都丢失了。

进入2000年以后，随着像Nongwoo bio这样的国内企业开始宣战，目前在韩国种子公司的国内市场占有率达到了近一半。然而现实是外国企业仍占据了过半数的52%。在这种情况下，随着东部收购孟山都韩国的大部分事业权，国内企业占有率提高到了65%。

东部方面和孟山都从去年开始推进谈判，并成功签约。得知孟山都想将巨大的市场集中在中国，要整理韩国部分事业的这一信息，就快速与其进行接触并成功收购。东部甚至接收了孟山都韩国的海南ㆍ高城农场和加工、物流中心。孟山都韩国所有的设施，只留下了鸟致院研究开发中心。

也有人指出孟山都此次并未交出精选的种子。对于像番茄和红椒一样，在国内培养后进行大量出口的品种，孟山都仍然控制在怀。首尔大学姜炳哲(音，植物生产科学部)教授表示“未将核心作物事业权转交是出于是绝对不会放弃对一年可达32万亿韩元的世界种子市场的主导权的意图”，“收回本土种子主权的同时，国内企业也应致力于开发可向全世界销售的新种子”。