韩国食品医药品安全厅被指责在中国产三聚氰胺饼干问题上应对缓慢，导致韩国国内人心惶惶。韩国政府二元化的食品行政体制也导致了食品医药品安全厅的这次失误。现在，政府的食品安全管理体制由食品医药品安全厅和农林水产部分开管理。肉质含量在50%以上或者乳脂肪含量在6%以上的产品由农林水产部旗下的农产品品质管理院和国立兽医科学检疫院负责管理，其余食品由食品医药品安全厅管理。根据该标准，奶粉安全管理将由农林水产部负责。

9月8日，中国食用含有三聚氰胺奶粉的婴儿死亡消息一经传开，食品医药品安全厅公开宣称“未进口中国产奶粉”，并将责任推卸给农林水产部。之后，有消息称不仅奶粉和牛奶，连乳加工产品也有可能被三聚氰胺污染之后，食品医药品安全厅才慢腾腾地制定应对策略。就在政府部门之间相互推卸责任时，国民的安全已岌岌可危。

从卢武铉政府开始，就在推进食品安全体制一元化方案。但是，当时这种努力最终演化成了保健福祉部和农林部之间的力量角逐，而最终化成了泡影。政府今年3月公布了食品安全综合对策，但是其中未包括食品安全体制一元化的方案。实际上，欧盟等发达国家由负责保健的政府部门统一开展食品安全的所有业务。原因在于，有担心称，从部门特点上来说农林水产部将农民渔民等生产者的利益放在首位，但是却忽视消费者的安全。英国在疯牛病风波时，为了保护畜产农民的利益推迟公布疯牛病的消息，结果导致了严重损失。之后，由保健部旗下的食品安全管理局（FSA）统一负责所有的食品安全。

对被怀疑为有害食品的预防措施也是微乎甚微。欧盟《食品安全法》中，规定有“预防原则(Precautionary priciple)”。对即使未证实有危险因素，但是却有可能是有害食品的，立即采取措施禁止食品进口和销售。食品医药品安全厅在中国三聚氰胺奶粉事件被曝光之后半个月，即9月25日才禁止进口，9月26日才采取禁止出售措施。