对于强化了独岛领土权主张的日本初中教科书审定结果，韩国政府出面采取了强硬应对。韩国政府动员了一切外交渠道，外交部长金星焕、韩国驻日本大使权哲贤亲自口头进行了严重抗议。外交部发表了最高级别的声明。教育科学技术部向日本文部科学省发送了抗议书函，要求日本撤销认定。另外，相关部门还发表了加强对独岛有效控制的措施。其中包括加快综合海洋科学基地建设、提前完成独岛居民宿舍的建造、整顿并扩充独岛警备队设施等。

韩国政府的此番应对可能是因为认为如果这次不采取坚决的措施，日本很难停止自己的独岛领土权主张。预计日本还将通过4月的《外交蓝皮书》和7月的《国防白皮书》确认对独岛的领土权。从本次初中教科书的审定结果推断，明年的高中教科书审定结果显然会恶化。

还有分析认为，韩国政府就日本东部地震采取积极的对日救护外交也是本次采取强硬应对的背景。为了防止国民们责难“争先恐后地帮助日本，换来的却是教科书问题后退”，同时想明确地向日本方面表明“人道主义援助和独岛问题等两国悬案是完全无关的”的讯息，所以才不可避免地采取了强硬的应对。但专家们的普遍看法是，如果韩国政府采取刺激性的应对，只会使外交损失增大。稍有不慎就会陷入日本想使独岛成为纷争地区从而放其放入国际司法舞台的意图中。

此次教科书审定结果也很有可能会使期间一直顺风顺水的韩日关系冷却，也许还会对两国间缔结自由贸易协定（FTA）的研讨、防卫领域的合作问题产生不良影响。预定在5月举行的韩中日首脑会谈也会在尴尬的氛围中进行。首尔大学教授朴喆熙（日本政治）表示：“我个人认为，因为日本通过‘改坏教科书’使情况恶化了，所以韩国也应该采取相应的有效控制措施。”