韩方在6月5日最终确认，从韩国全罗北道群山的乌鸡农场开始，扩散至全国的禽流感是对鸡鸭等家禽类具有高致死率的高致病性禽流感病毒。韩国农林畜产食品部当日表示，6月2日最初在对进行疑似病例举报的济州市一农家进行精密检查的结果显示，该病毒为H5N8高致病性禽流感病毒。韩国政府在此后召开了农林畜产食品部等相关部长会议，在6月6日0时将禽流感风险预警上调至最高水平，即“严重”阶段。根据严重阶段风险预警预案，6月7日0-24时的24小时内将对韩国全国所有家禽养殖农场实行“家禽暂时禁运令”（Standstill）。

当日，根据韩国农林畜产食品部的报道，现在已确认感染禽流感的农场有群山、济州、梁山、机张、坡州和蔚州等6个市郡的8家农场。全罗北道群山市的农场被推测为此次禽流感病毒扩散的源头，该农场销售至全国的3600只乌鸡被出售至上述地区的农场内。

图为6月5日防疫工作人员正在将在釜山机张郡的一家农场内被宰杀的鸡等运至掩埋地点。（图片来源： 宋奉根记者）

韩政府当日对济州、群山、坡州、梁山和机张地区18个农场的3.1913万只家禽进行了宰杀，并禁止全国市场和饭店进行活鸡交易。

韩国防疫当局正在对禽流感发生的原因进行防疫学方面的调查，推测此次发现的H5N8型禽流感病毒可能是在粪便等外部环境或是在感染病毒的家禽身上存留后扩散所致。

韩国环境相关团体表示，“我们应以此次疫情为契机，将禽流感看做常态化、当地化的家畜传染病之一。政府应强化农场的饲养标准等，考虑对根本制度进行改善”。