法务部部长黄教安10月24日发表了正式道歉文，他表示“对于发生在检方身上的不光彩的事情，我表示遗憾，并向国民表示歉意”。就在三天前的21日，针对国家情报院介入大选一事，搜查组长骊州地方厅长尹锡悦和首尔中央地方检察长曹永昆在国政监查现场发生了正面冲突。

黄部长在发表文中首先表示“我认为检方应在政治上保持中立性和独立性”。接着他讲道“但是目前的一连串事件表明，正在进行搜查或审理的案件还未得出结论，政治争论就在不断进行中。我认为这是不妥当的”，表示了担忧。他表示“今后，首尔中央地方检察厅要全力以赴，进行彻底的搜查，严格审判，保证将准确的事实真相告知国民，不让这次的事件留下任何质疑”。

他还表示应该尽快结束目前已持续了近一个月的总长空白事态。他表示“期待今天举行的检察总长候选人推荐委员会推荐出能带领检方走出困境的优秀人士来”，“我们会尽快从候选人中选出一人担任检察总长，弥补空白期，稳定检察厅，重获国民的信任”。 　

据悉，黄部长在首尔中央地方检察厅国政监查的第二天，即22日上午在青瓦台国务会议上汇报说“让您担心了，对此我深表愧疚。我会尽全力让检察厅稳定下来”。听说朴槿惠总统并没有任何回答。因此，针对当天黄部长发布道歉文一事，有分析认为“青瓦台正在沉默中，这算是代表政府向国民道歉”。

但是，检方内部的主流观测认为，被认为是典型公安通的黄部长本人在由此次国情院事件引发的矛盾中绝不可能独善其身。据悉，今年5月搜查组在讨论起诉帖子事件时认为可以适用《公职选举活动》，但黄部长在听取了汇报后表示反对。此前，尹地方厅长在首尔中央地方检察厅国政监查中就曾主张“从5月底起对法务部进行了两周的内部说明。我在想法务部有必要这样做吗。搜查的人觉得那是‘外部压力’”。他对于民主党方面提出的“从搜查初期一开始就有的压力与黄教安部长有关吗？”的问题回答说“我认为不无关系”。

搜查组在公诉时效到期的五六天前，即今年6月14日称前国情院长元世勋违反了《公职选举法》，对其进行了不拘留起诉。当时出现了部长错误行使搜查指挥权的争论后，黄部长立即解释说“是惯例性的意见交换”。