由于其过高的开发费用和时间问题等，FCS在开发期间饱受批判。投入FCS的费用将有2000亿美元，这还是除掉支援需要的高速收音机、无线网络、人工卫星系统等开发所需的800亿美元以后的数字。缓慢的开发速度也是个问题。
FCS的命运将受最近的金融危机以及美国大选结果的影响的可能性很大。若投入7000亿美元进行金融救市的话，国防产业无论如何都会因此受到负面影响。
大选结果也很重要。民主党的巴拉克·奥巴马和共和党的约翰·麦凯恩两位候选人无论是谁当选，国防经费支出的修订都是不可避免的。要削减新式武器开发事业的费用已成事实，问题是削减的幅度。据较悲观的分析，FCS开发预算可能会削减一半。
《洛杉矶时报》10月13日报道称，如果麦凯恩当选的话，就意味着他将成为继德怀特·艾森豪威尔以来入主白宫的最精通军事状况的总统。但是因为麦凯恩对军队内部比较了解，所以军部向民间政治家们所用的那一套是行不通的。
麦凯恩尤其严厉批判FCS，认为其花费太高，应减少预算。奥巴马也坚持修订国防预算的立场，他认为将钱用于医疗系统、生活改善和追加购买现有武器上要好得多。
加上最近围绕FCS的军部内部矛盾说也被曝出。尤其是从伊拉克和阿富汗回来的军官中，一部分人批判FCS是不符合现实的。他们认为与以远距离战斗为前提条件的FCS不同，在实际战争中近距离战斗是不可避免的事情。
最近国防部确定把支援FCS的下一代军事用人造卫星开发企业的选定延期到明年，这使得事态更加迷离。美军的立场是，因为美国武器体系由冷战时期开发的落后又老化的装备构成，所以即使投入一些经费这也是现代化和尖端化的需要所然。且FCS的开发已经进行了三分之一，已开发出来的FCS装备的性能也得到了不错的评价。
FCS计划已经不是第一次受到挑战了。即使在各种情况都不能预期的情况下，FCS计划也是一直进行的。FCS的开发涵盖41个州，有550多个公司参与。这就意味着此计划和各地区的当权者的政绩工作紧密相联。因此，比起废止，修改的可能性更大一些。
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