韩总统室7月13日将“脱北渔民遣返事件”定义为“反人道犯罪行为”，并表示“将彻查事件真相”。韩总统室发言人姜仁仙当天上午在通气会上表示，“照片拍下了2019年11月7日下午3时抵达板门店的两名脱北渔民拒绝被遣返的场面”，“两人为了不被拖走而拼命挣扎的样子与文在寅政府‘丝毫没有归顺意向’的说辞截然不同”。韩统一部前天公开了数张当时脱北渔民为了不被送回板门店军事分界线对侧而奋力抵抗的照片。
韩总统室发言人姜仁仙称，“如果两人表明了归顺意向却仍被强制遣返，这将构成违反国际法和宪法的反人道、反人类犯罪行为”，“因此必须查明真相。尹锡悦政府将彻查这起事件的真相，恢复自由与人权的普遍价值”。就发布这一官方立场的理由，韩总统室负责人介绍称，“在看到惨不忍睹的照片后，很多人应该都会感到震惊。因此需要对此事作出整体表态”。
韩总统室内部还有人提出针对上届政府人士作出惩罚的可能性。某参谋人员表示，“违反我国司法当局的审判程序等直接将人遣返回朝鲜的上届政府相关人员存在滥用职权或伪造、使用虚假公文等嫌疑”。
尹锡悦虽未亲自谈及这起事件，却第一次以总统身份出席了当天在板桥信息保护园区举行的“信息保护日”纪念活动。尹锡悦表示，“为应对逐渐演变成混合战争(Hybrid War)的战争形态，将提升网络战斗力和技术”，“并创建能够把军队专业领域兵役和退伍后就业、创业结合到一起的‘网络特比昂(Talpiot)’以及能够在国家紧急情况下集结民官力量的‘网络预备军’，加强网络战争(Cyber War)的执行能力”。特比昂是以色列的精英科学技术专业军官项目。为解决网络人才短缺的问题，尹锡悦提出“将扩大大学和研究生院网络专业课程，培养最精锐的开发人才和白帽黑客，通过此体系培养10万人才”的解决方案。
对于公开的脱北渔民被遣返照片，韩执政党和在野党展开了激烈交锋。代行国民力量党首职务的院内代表权性东当天批判道，“根据韩国宪法和法律，归顺的脱北渔民就是大韩民国国民”，“未对两人的犯罪行为展开调查就凭信朝方说辞而将其强制遣返，这是严重的人权蹂躏行为，也是违反宪法和法律的行为”。韩统一部长权宁世也表示，“无论是杀人犯还是残忍罪犯，在经审判作出确定判决之前，都应遵守无罪推定的原则”，“只通过简单的行政调查就将其驱逐回朝鲜，这是明显的错误行为”。
共同民主党对此开始作出强力反击。共同民主党非常对策委员长禹相虎反驳道，“我们是从引渡罪犯的层面将脱北渔民引渡给朝鲜，把这一做法定义为反人道罪行，未免太过分了”，“请问(脱北渔民)杀害16名同船船员是人道之举吗”。共同民主党西海公务员死亡事件工作小组(组长金炳周议员)在国会召开新闻发布会，公开了脱北渔民被抓获和遣返的过程，并介绍称“大家可能误会脱北渔民是主动投韩，事实上他们是被我军活捉的”。尹建永议员表示，“我们不能拿国民税金来保护野蛮的杀人犯”。
